Anders als bei den Seeführerscheinen ist die Anzahl der Scheine hier eher überschaubar. Im wesentlichen gibt es den Sportbootführerschein Binnen. Dieser gilt für die in der Binnenschiffahrtsstraßen-Ordnung aufgelisteten Wasserstraßen. Darüber hinaus gibt es das Bodensee-Schifferpatent zum Führen von Fahrzeugen auf dem Bodensee. Zu beachten ist, dass losgelöst von der Binnenschiffahrtsstraßen-Ordnung jeder größere Fluss in Deutschland seine eigne Schifffahrtsstraßenordnung hat.